Hola, Andavaros.
Puedes hacer un préstamo a tu pareja sin problema. Para ello es importante que creéis un contrato indicando el importe que le prestarás y el plazo para reembolsarlo así como el coste (aunque sea gratuita) y deis conocimiento a Hacienda para evitar malentendidos. Si quieres, en esta página sobre préstamos entre particulares encontrarás en detalle cómo proceder ante Hacienda y qué documentación presentar.
No entendemos muy bien a qué te refieres con hacer un cheque bancario para pagar la vivienda, ¿nos podrías explicar un poco más para poder ayudarte?
¡Un saludo!