Hola, Mónica.
Si tu empresa corrobora que te ha pagado la nómina, deberías ponerte en contacto con tu banco para preguntarle si te ha retenido el importe por algún motivo y solicitar el desbloqueo. En caso de que el banco te comunique que ellos no han llevado a cabo ninguna acción, solicita a la empresa un comprobante de la transferencia para confirmar que el número de cuenta es correcto y no se ha producido ningún error en el pago.
Saludos.